RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSF2P04141 144 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERPING1P05155 500 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1SP09871 688 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCK1P35558 622 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 IRF4Q15306 451 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 IFT43Q96FT9 208 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITPR1Q14643 2758 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 K7ESM1 405 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 RARAP10276 462 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 JUPP14923 745 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 HCAR3P49019 387 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 DAB2P98082 770 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 DPYSL2Q16555 572 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 UGP2Q16851 508 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRLQ86TD4 932 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 APOLD1Q96LR9 279 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUP85Q9BW27 656 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NENFQ9UMX5 172 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 H3BRJ5 948 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCAMP1O15126 338 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 C6P13671 934 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CASP14P31944 242 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL10RBQ08334 325 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFKBIBQ15653 356 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 DONSONQ9NYP3 566 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 LAMA5O15230 3695 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PEX11BO96011 259 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYP1A2P05177 515 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 JUNDP17535 347 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 MMP12P39900 470 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ILKQ13418 452 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMX1AQ8TE12 382 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD48P09326 243 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CKMT1AP12532 417 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 HNF1BP35680 557 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSNK1DP48730 415 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIG3P49916 1009 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 THOP1P52888 689 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELP6Q0PNE2 266 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 RALGDSQ12967 914 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1orf61Q13536 156 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACAP1Q15027 740 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCTD16Q68DU8 428 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 PGBD5Q8N414 524 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 DKK4Q9UBT3 224 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 RP1P56715 2156 aa22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 AQP9O43315 295 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 GCATO75600 419 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARL4AP40617 200 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCNN1BP51168 640 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 MMRN1Q13201 1228 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRM3Q14832 879 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCEA2Q15560 299 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 BOLA3Q53S33 107 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFAP58Q5T655 872 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms