RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 MAGEC1O60732 1142 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 MAP3K6O95382 1288 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CER1O95813 267 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CEACAM1P13688 526 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TNNT1P13805 278 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 MX2P20592 715 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SERPINA4P29622 427 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CDKN2BP42772 138 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 VAV2P52735 878 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 C21orf59P57076 290 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 AP1S1P61966 158 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 BCL2L1Q07817 233 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 BBS5Q8N3I7 341 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CENPTQ96BT3 561 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 MGME1Q9BQP7 344 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 NOD2Q9HC29 1040 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 AMACRQ9UHK6 382 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 GGT7Q9UJ14 662 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.5□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 H0Y8X5 98 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 RAD51BO15315 384 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SH3BP5O60239 455 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PCDHGA12O60330 932 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CCNB1P14635 433 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PRLRP16471 622 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CES1P23141 567 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 AKT2P31751 481 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 MMP13P45452 471 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 RXRGP48443 463 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 GSDMDP57764 484 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 FOXK2Q01167 660 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SGCGQ13326 291 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ZNF235Q14590 738 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 IHHQ14623 411 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PPM1JQ5JR12 505 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 DAAM2Q86T65 1068 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 HDAC11Q96DB2 347 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 LGMNQ99538 433 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ITM2BQ9Y287 266 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 A0A1B0GTQ1 180 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 A0A1W2PQ67 120 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CFAP69A5D8W1 941 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 POM121BA6NF01 834 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 GIPC1O14908 333 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 MMP20O60882 483 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TM7SF2O76062 418 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 KRT1P04264 644 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 KRT10P13645 584 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 NR2C2P49116 596 aa8.49□□□□□ -1.05
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PPARG-201ENST00000287820 MAXP61244 160 aa8.49□□□□□ -1.05
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PPARG-201ENST00000287820 ELP6Q0PNE2 266 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 TFDP2Q14188 446 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SHBQ15464 509 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ODF2Q5BJF6 829 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 CCNYQ8ND76 341 aa8.49□□□□□ -1.05
PPARG-201ENST00000287820 DEFB124Q8NES8 71 aa8.49□□□□□ -1.05
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