RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 SMTNL1A8MU46 457 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 NBNO60934 754 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF853P0CG23 659 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF12P17014 697 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 YWHAQP27348 245 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 KIF5BP33176 963 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 PTPN9P43378 593 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 RXRGP48443 463 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 MVDP53602 400 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 BPIFB3P59826 476 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ARHGAP8P85298 464 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 FOXO1Q12778 655 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TRAF2Q12933 501 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 COASYQ13057 564 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TRAF3Q13114 568 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CUL4BQ13620 913 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM29Q14134 588 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 PTPN14Q15678 1187 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ARL10Q8N8L6 244 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GPT2Q8TD30 523 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TXNDC15Q96J42 360 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SPAG5Q96R06 1193 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 FIZ1Q96SL8 496 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CENPOQ9BU64 300 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TSPYL1Q9H0U9 437 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ABCG4Q9H172 646 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GRHL1Q9NZI5 618 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SNX5Q9Y5X3 404 aa3.21□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 K7ENM7 598 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 HBP1O60381 514 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SERPINI2O75830 405 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF432O94892 652 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 METTL18O95568 372 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SKILP12757 684 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CD72P21854 359 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ABCD1P33897 745 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 MTNR1AP48039 350 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 BNC1Q01954 994 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 BIRC3Q13489 604 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 PARP10Q53GL7 1025 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CUZD1Q86UP6 607 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TEX45Q8NA69 505 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 IL17REQ8NFR9 667 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TAF4BQ92750 862 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 DONSONQ9NYP3 566 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 NLKQ9UBE8 527 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GPRASP1Q5JY77 1395 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 A0A096LPK6 155 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 DENND3A2RUS2 1198 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 OR6C68A6NDL8 312 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CPLX1O14810 134 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CAMTA2O94983 1202 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 AGR2O95994 175 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 IL1AP01583 271 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC175P0C221 793 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 MT3P25713 68 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 GJC1P36383 396 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ERVFC1-1P60608 527 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 KRT72Q14CN4 511 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SLC39A14Q15043 492 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 PPP2R5BQ15173 497 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 ME3Q16798 604 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.2□□□□□ -1.9
GPBP1-201ENST00000264779 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms