RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 C5orf22Q49AR2 442 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.62■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MOCOSQ96EN8 888 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 DKK3Q9UBP4 350 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 TACC2O95359 2948 aa16.62■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 NEMP1O14524 444 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 AREL1O15033 823 aa16.61■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0D9SEW6 157 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RHOCP08134 193 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRF1P14222 555 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TCN2P20062 427 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 NR1D2Q14995 579 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CNGA2Q16280 664 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 AMZ1Q400G9 498 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf46Q6P387 395 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.6■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 CEP44Q9C0F1 390 aa16.6■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC2A3P11169 496 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN7P41732 249 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 ALFQ53S48 1182 aa16.59■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 ANKS6Q68DC2 871 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.59■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.59■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KLQ9UEF7 1012 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.59■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MMP20O60882 483 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 RFPL1O75677 317 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TM7SF2O76062 418 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 THRAP10827 490 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CCR1P32246 355 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 RAB15P59190 212 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD18Q0P651 414 aa16.58■□□□□ 0.24
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