RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 IPMKQ8NFU5 416 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CCT7Q99832 543 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FICDQ9BVA6 458 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HHLA1C9JL84 531 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CYTH1Q15438 398 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT8Q9NY28 637 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SQORQ9Y6N5 450 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CSPG5O95196 566 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PYGLP06737 847 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PAMP19021 973 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX17Q15036 470 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MOB2Q70IA6 237 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CUZD1Q86UP6 607 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GAB3Q8WWW8 586 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 LZICQ8WZA0 190 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC29A1Q99808 456 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 OLAHQ9NV23 265 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NEU3Q9UQ49 428 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 IPPQ9Y573 584 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GMEB1Q9Y692 573 aa22.31■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 A8MT66 165 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CPB1P15086 417 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNA5P22460 613 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A2P55011 1212 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GEMP55040 296 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBA4AP68366 448 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MTX3Q5HYI7 312 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 EDEM1Q92611 657 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RALGDSQ12967 914 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PCED1BQ96HM7 432 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MAML3Q96JK9 1138 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CROTQ9UKG9 612 aa22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PTGESO14684 152 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MRASO14807 208 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HDCP19113 662 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP4BP51164 291 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CSHL1Q14406 222 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKFN1Q8N957 763 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HM13Q8TCT9 377 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RANBP9Q96S59 729 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CHST12Q9NRB3 414 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NRP2O60462 931 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ARSAP15289 507 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF280DQ6N043 979 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 DFFAO00273 331 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GPC4O75487 556 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ACADVLP49748 655 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms