RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000164227.9

BCL3-201, Transcript of B cell CLL/lymphoma 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCL3, Length 2,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3-201ENST00000164227 RAB27AP51159 221 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PTK2BQ14289 1009 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SLC22A9Q8IVM8 553 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 LILRA2Q8N149 483 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 AHI1Q8N157 1196 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SPATA6LQ8N4H0 392 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 NAT14Q8WUY8 206 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 NPAS2Q99743 824 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.81■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PENKP01210 267 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PMLP29590 882 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 H0YJX3 145 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 WNT3AP56704 352 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PSME3P61289 254 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CSHL1Q14406 222 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ACAP2Q15057 778 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PKP2Q99959 881 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ZNF696Q9H7X3 374 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 AP4B1Q9Y6B7 739 aa26.8■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 A8MT66 165 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 KCNU1A8MYU2 1149 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CHRNA4P43681 627 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 FKBP1BP68106 108 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SEPT6Q14141 434 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TRMOQ9BU70 441 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 NDFIP2Q9NV92 336 aa26.79■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 E9PAM4 449 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 KPNA6O60684 536 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 C8BP07358 591 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SLC26A3P40879 764 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 RPL5P46777 297 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CREB5Q02930 508 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SPRYD7Q5W111 196 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CASP10Q92851 521 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SGF29Q96ES7 293 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 UBXN10Q96LJ8 280 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 C1orf74Q96LT6 269 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 OLFM1Q99784 485 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 VPS45Q9NRW7 570 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 UBAP1Q9NZ09 502 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ZNF623O75123 536 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.882e-6■■□□□ 12
BCL3-201ENST00000164227 LSAMPQ13449 338 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 LRP8Q14114 963 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 GK5Q6ZS86 529 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.78■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 UTRNP46939 3433 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 UBDO15205 165 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 GPR182O15218 404 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TNFAIP8O95379 198 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ATP4BP51164 291 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 USP41Q3LFD5 358 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 HACD2Q6Y1H2 254 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CUZD1Q86UP6 607 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 OR10T2Q8NGX3 314 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 RIN3Q8TB24 985 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 NEMP2A6NFY4 417 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TNFRSF10BO14763 440 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 B3GAT3O94766 335 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SLC5A3P53794 718 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 TSPY1Q01534 308 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SPATA24Q86W54 205 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 RNF148Q8N7C7 305 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 HMGCLL1Q8TB92 370 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 HS3ST4Q9Y661 456 aa26.77■■□□□ 1.88
BCL3-201ENST00000164227 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
BCL3-201ENST00000164227 AURKAO14965 403 aa26.76■■□□□ 1.87
BCL3-201ENST00000164227 TRIM24O15164 1050 aa26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms