RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056749.13

Nhlrc3-201, Transcript of NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nhlrc3, Length 5,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 H2-Q2Q4KN81 360 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 MarcoQ60754 518 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Usp17laQ61068 526 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PtprjQ64455 1238 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Teddm1aQ810U2 305 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Trpa1Q8BLA8 1125 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam126bQ8C729 530 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 NoboxQ8VIH1 527 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp4f13Q99N19 523 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Asf1aQ9CQE6 204 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 CenpnQ9CZW2 337 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Col2a1P28481 1487 aa11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam166bA2AIP0 273 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rap1gds1E9Q912 607 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ptpn9O35239 593 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Angpt2O35608 496 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Grk4O70291 574 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Bmp4P21275 408 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tead2P48301 445 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tas2r16P59529 299 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 H2-M3Q31093 336 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cd300aQ6SJQ0 318 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Olfr1355Q7TQU9 310 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Q8CIL4 281 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Kremen2Q8K1S7 461 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Taf11Q99JX1 211 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Det1Q9D0A0 550 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PrebQ9WUQ2 417 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cntnap4Q99P47 1310 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prkag1O54950 330 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ripk2P58801 539 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ctps1P70698 591 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PrkcqQ02111 707 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ugt3a1Q3UP75 523 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Otol1Q4ZJM7 482 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PmlQ60953 885 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rasa4Q6PFQ7 802 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sytl5Q80T23 753 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zfyve1Q810J8 777 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ulbp1Q8HWA3 334 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 St8sia6Q8K4T1 398 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fndc5Q8K4Z2 209 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zfp709Q8VC29 727 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Olfr1467Q8VFW1 308 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ppa2Q91VM9 330 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Aipl1Q924K1 328 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Msh4Q99MT2 958 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rasgef1cQ9D300 466 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Klrc2Q9WTJ9 238 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ltn1Q6A009 1767 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sec14l1A8Y5H7 715 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm10639E9Q6L7 222 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gsg1l2M0QWL6 290 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gsta2P10648 222 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Msr1P30204 458 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 EdnrbP48302 442 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc26a1P58735 704 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Itpripl2Q3UV16 535 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Klra8Q60682 266 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ndrg1Q62433 394 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gpr61Q8C010 449 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Epn2Q8CHU3 595 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mrto4Q9D0I8 239 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vwa7Q9JHA8 891 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ror1Q9Z139 937 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Golga4Q91VW5 2238 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Itga8A2ARA8 1062 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp2j12G3UXT0 502 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 InvsO89019 1062 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AxlQ00993 888 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tff2Q03404 129 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Serpina6Q06770 397 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dus1lQ8C2P3 475 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slfn5Q8CBA2 884 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Satl1Q9D5N8 744 aa11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Scarf2P59222 833 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 KapP61110 121 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ulk3Q3U3Q1 472 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 MogQ61885 246 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tecpr1Q80VP0 1166 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc18a2Q8BRU6 517 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc44a2Q8BY89 706 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prdm8Q8BZ97 687 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 B3galt6Q91Z92 325 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 GzmnQ920S1 248 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cpt1bQ924X2 772 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Yipf2Q99LP8 312 aa11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sp2Q9D2H6 612 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.1 ms