RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, human

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRVP-205	ENST00000641549	KCNH1	O95259	989 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	BST1	Q10588	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549		M0R2N6	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC16A1	P53985	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549		A8MX80	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ULK1	O75385	1050 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	MYBL2	P10244	700 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMEM245	Q9H330	911 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	FSBP	O95073	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	COX7A2	P14406	83 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	NCF4	Q15080	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	GMIP	Q9P107	970 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	LGR5	O75473	907 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TNNI3	P19429	210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	CBX6	O95503	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	GSTM1	P09488	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PIK3R1	P27986	724 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	LRPAP1	P30533	357 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	NTS	P30990	170 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ABCG1	P45844	678 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	CLCNKB	P51801	687 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	MAX	P61244	160 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PEX6	Q13608	980 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	MYO19	Q96H55	970 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PROC	P04070	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	CTSE	P14091	401 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	POU1F1	P28069	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	IFNGR2	P38484	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	COG5	Q9UP83	839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	INVS	Q9Y283	1065 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	CLPTM1	O96005	669 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SOX6	P35712	828 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	EPS8	Q12929	822 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRVP-205	ENST00000641549	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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