RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PMEPA1Q969W9 287 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TOR3AQ9H497 397 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SNTG2Q9NY99 539 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.27□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PMM2O15305 246 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 IL7RP16871 459 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GLDCP23378 1020 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TGFBR1P36897 503 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TNFSF9P41273 254 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RAP1GAPP47736 663 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NME5P56597 212 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ROR1Q01973 937 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KCNJ11Q14654 390 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FXNQ16595 210 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TBCELQ5QJ74 424 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NEK5Q6P3R8 708 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CADM2Q8N3J6 435 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HMG20AQ9NP66 347 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 WDR27A2RRH5 827 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HCRTO43612 131 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NUAK1O60285 661 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GRAP2O75791 330 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KRT19P08727 400 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCND2P30279 289 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GLRBP48167 497 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RHDQ02161 417 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FOCADQ5VW36 1801 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TTC23LQ6PF05 361 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TTC39CQ8N584 583 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 POC5Q8NA72 575 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 EXD2Q9NVH0 621 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TTC34A8MYJ7 566 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TBX1O43435 398 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SCO1O75880 301 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 STAM2O75886 525 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCNKO75909 580 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK2O95069 426 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VNN1O95497 513 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KRT3P12035 628 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V1B2P21281 511 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RBL1P28749 1068 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NAMPTP43490 491 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G16P53816 162 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ACTR2P61160 394 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CDK18Q07002 472 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 EMC2Q15006 297 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC103Q8IW40 242 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM192Q8IY95 271 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NDNFQ8TB73 568 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BHMTQ93088 406 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms