RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 POLBP06746 335 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ALADP13716 330 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 STX2P32856 288 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 STK19P49842 368 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF844Q08AG5 666 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PCID2Q5JVF3 399 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TERB1Q8NA31 727 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GSDMBQ8TAX9 411 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIB3Q96RU7 358 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 RANBP9Q96S59 729 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3GL2Q99962 352 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPV5Q9NQA5 729 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOVL2Q9NXB9 296 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX13Q9UN79 622 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 COL4A2P08572 1712 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L10A6NI86 522 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS5O75159 536 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OPRD1P41143 372 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM193AP78312 1265 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMB3Q13751 1172 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 HSP90B2PQ58FF3 399 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKKQ5KSL6 1271 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP85LQ5SZL2 805 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CERCAMQ5T4B2 595 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PHTF2Q8N3S3 785 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRE3Q9BY15 652 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TM6SF2Q9BZW4 377 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CIPCQ9C0C6 399 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSS3Q9H6R3 686 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO10Q9HD67 2058 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GJB3O75712 270 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 USP1O94782 785 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SHBGP04278 402 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A11P48066 632 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD51Q06609 339 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 E2F5Q15329 346 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DLG2Q15700 870 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL38Q2WGJ6 581 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRPB2Q5JXA9 342 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXN3Q5MJ09 141 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC5AQ6ZN44 842 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM135Q86UB9 458 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 UCMAQ8WVF2 138 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP36Q96G28 342 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPRX3Q96LB0 322 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 KIFC1Q9BW19 673 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 RAI2Q9Y5P3 530 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-206ENST00000588815 C2CD4DB7Z1M9 353 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ADRA1DP25100 572 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ST8SIA6P61647 398 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CARD16Q5EG05 197 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF449Q6P9G9 518 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 Q7L0L9 218 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2W6PQ8NHA6 318 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 GUCD1Q96NT3 240 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G4CQ9UP65 541 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL26P61254 145 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ACCSLQ4AC99 568 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 KDELC2Q7Z4H8 507 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF135Q8IUD6 432 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CYTH2Q99418 400 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAG3Q9UGI9 489 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RABGEF1Q9UJ41 708 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa31.3■■■□□ 2.6
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CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH1A2O94788 518 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 POP4O95707 220 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
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CAPNS1-206ENST00000588815 TPH1P17752 444 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNA4P43681 627 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CRADDP78560 199 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2L1Q07817 233 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT71Q3SY84 523 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LEXMQ3ZCV2 418 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPN12Q6ZSI9 719 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A41Q8N5S1 370 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FBF1Q8TES7 1133 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 NSMCE3Q96MG7 304 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGRF2O14827 1237 aa31.29■■■□□ 2.6
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