RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PIGVQ9NUD9 493 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ILVBLA1L0T0 632 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 C9orf172C9J069 976 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TOR1BO14657 336 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PMM2O15305 246 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 P4HA2O15460 535 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 DAB1O75553 588 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CASRP41180 1078 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CCR10P46092 362 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SULT1E1P49888 294 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT85P78386 507 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF7Q14155 803 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP9Q49MG5 647 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 DTX1Q86Y01 620 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 BLACEA4D250 179 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 DRGXA6NNA5 263 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 STMND1H3BQB6 276 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SNX16P57768 344 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ARF5P84085 180 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ALG11Q2TAA5 492 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 DRC7Q8IY82 874 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 KLQ9UEF7 1012 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZMPSTE24O75844 475 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 GNA12Q03113 381 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 DEUP1Q05D60 604 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 STIM1Q13586 685 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 IRF4Q15306 451 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 GLB1P16278 677 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CXCR3P49682 368 aa22.04■■□□□ 1.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC6A3Q01959 620 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ATL2Q8NHH9 583 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP63Q96MT8 703 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 RRN3Q9NYV6 651 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PSMA7O14818 248 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 F9P00740 461 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TNFP01375 233 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ERBB2P04626 1255 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PEX5P50542 639 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC14Q15048 493 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 AMZ1Q400G9 498 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SPRED1Q7Z699 444 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 APPL1Q9UKG1 709 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 B4DGG1 531 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 AREL1O15033 823 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SMC2O95347 1197 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CCL4P13236 92 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ITIH2P19823 946 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 NFATC4Q14934 902 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 C16orf72Q14CZ0 275 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 MYLK3Q32MK0 819 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PIM3Q86V86 326 aa22.02■■□□□ 1.12
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