RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-208	ENST00000586900	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-208	ENST00000586900	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	C5orf60	A6NFR6	353 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	C10orf142	B7Z368	130 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	KCNN4	O15554	427 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	MAP3K13	O43283	966 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	AP1G1	O43747	822 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	RHOBTB1	O94844	696 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PIGN	O95427	931 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SERPINF2	P08697	491 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CA4	P22748	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	METAP1	P53582	386 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	NUMA1	Q14980	2115 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CEP68	Q76N32	757 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FRMD1	Q8N878	549 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	COG1	Q8WTW3	980 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	TADA1	Q96BN2	335 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	AGAP3	Q96P47	875 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FCRL5	Q96RD9	977 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	RNF14	Q9UBS8	474 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900		R4GN57	208 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	THADA	Q6YHU6	1953 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FANCG	O15287	622 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FZD6	O60353	706 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	OPHN1	O60890	802 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	NDUFS2	O75306	463 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	GCAT	O75600	419 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	GJB3	O75712	270 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SEMA4F	O95754	770 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ITGAV	P06756	1048 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	MMP2	P08253	660 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ADRB3	P13945	408 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	TIMP2	P16035	220 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CASQ1	P31415	396 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ACSL1	P33121	698 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ADPRH	P54922	357 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SKOR1	P84550	965 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	DSC2	Q02487	901 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ELF2	Q15723	593 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PLK5	Q496M5	336 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PMS2CL	Q68D20	193 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PRELID2	Q8N945	189 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	FOXJ1	Q92949	421 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	MS4A14	Q96JA4	679 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	LOXL4	Q96JB6	756 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	SPATA13	Q96N96	652 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	CEP41	Q9BYV8	373 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	INVS	Q9Y283	1065 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PROB1	E7EW31	1015 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	AREL1	O15033	823 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF185	O15231	689 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	TSPAN6	O43657	245 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKN1-208	ENST00000586900	PGLS	O95336	258 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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