RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CA5A	P35218	305 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PLA2G4A	P47712	749 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF445	P59923	1031 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GPLD1	P80108	840 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM29	Q14134	588 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IL11RA	Q14626	422 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GSE1	Q14687	1217 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	NFKBIB	Q15653	356 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SV2C	Q496J9	727 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FAM35A	Q86V20	835 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	NUP93	Q8N1F7	819 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GALNT16	Q8N428	558 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ASB5	Q8WWX0	329 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SGSM3	Q96HU1	749 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LMLN	Q96KR4	655 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	RUFY1	Q96T51	708 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SARG	Q9BW04	601 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	COMMD8	Q9NX08	183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SARDH	Q9UL12	918 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	L1RE1	Q9UN81	338 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	DERA	Q9Y315	318 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TTC34	A8MYJ7	566 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772		K7ERI5	159 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ADAM10	O14672	748 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ALOX15B	O15296	676 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TOM1L1	O75674	476 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA0754	O94854	1291 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFA10	O95299	355 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PYGM	P11217	842 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CREB1	P16220	341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	LIG1	P18858	919 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	PEX19	P40855	299 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CCNF	P41002	786 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	LHX1	P48742	406 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	EPHB1	P54762	984 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MCL1	Q07820	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	INPP5A	Q14642	412 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	MPPE1	Q53F39	396 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DENND1C	Q8IV53	801 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CD302	Q8IX05	232 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SMC5	Q8IY18	1101 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DDI1	Q8WTU0	396 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	LACTBL1	A8MY62	500 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FAM189A1	O60320	539 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	SMPD2	O60906	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	TBX18	O95935	607 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSI2-216	ENST00000582772	FGF5	P12034	268 aa		5.01	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms