RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582717.5

GGA3-214, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-214	ENST00000582717	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	RCN3	Q96D15	328 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	PKP2	Q99959	881 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	TTC3	P53804	2025 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717	NUP205	Q92621	2012 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GGA3-214	ENST00000582717		A0A096LPK6	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717		A0A1W2PQY0	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TIMM44	O43615	452 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRPA1	O75762	1119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LRIG2	O94898	1065 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PSMC3	P17980	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PAX3	P23760	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PTPN3	P26045	913 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	HADHA	P40939	763 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SLC5A3	P53794	718 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	DRC3	Q9H069	523 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ZNF23	P17027	643 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SLC5A2	P31639	672 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CDKL1	Q00532	357 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ART3	Q13508	389 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	OLIG2	Q13516	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LHX8	Q68G74	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ACOT8	O14734	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	EOMES	O95936	686 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	GRIK1	P39086	918 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	TRIM38	O00635	465 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	INHA	P05111	366 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	MPST	P25325	297 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-214	ENST00000582717	HOXD10	P28358	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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