RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ARL4AP40617 200 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 RABIFP47224 123 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 GRM3Q14832 879 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 BOLA3Q53S33 107 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 AFMIDQ63HM1 303 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DHRS13Q6UX07 377 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 IFT43Q96FT9 208 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 BMFQ96LC9 184 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 THAP2Q9H0W7 228 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ZWILCHQ9H900 591 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 APC2O95996 2303 aa14.61□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 A0A087X0T9 212 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 POM121BA6NF01 834 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DFFAO00273 331 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 RFPL3O75679 317 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 PIGNO95427 931 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 C1SP09871 688 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 FAM228BP0C875 321 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CDK4P11802 303 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TIMP2P16035 220 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DGKAP23743 735 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 IL1R2P27930 398 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ACADVLP49748 655 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SUOXP51687 545 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DNAJC3Q13217 504 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DPYSQ14117 519 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DPYSL2Q16555 572 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP58Q5T655 872 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 LZTR1Q8N653 840 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 NPWQ8N729 165 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 HSPH1Q92598 858 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 NUP85Q9BW27 656 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 GPR27Q9NS67 375 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CHD6Q8TD26 2715 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TSPAN11A1L157 253 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 PALMO75781 387 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 PIAS2O75928 621 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TM7SF2O76062 418 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CYP1A2P05177 515 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CDC25BP30305 580 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CASP14P31944 242 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CSNK1DP48730 415 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF75DP51815 510 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 IL10RBQ08334 325 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ELP6Q0PNE2 266 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A45Q8N413 288 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TEKT4Q8WW24 435 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TSC1Q92574 1164 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM5Q9C035 493 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 PTPRBP23467 1997 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM3-215ENST00000568477 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM38O00635 465 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 FFAR2O15552 330 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 CBFA2T2O43439 604 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 SIGLEC6O43699 453 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 MMP20O60882 483 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 RARAP10276 462 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 ALPPL2P10696 532 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 TCF4P15884 667 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 CKMT2P17540 419 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 ITIH2P19823 946 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 SERPINA4P29622 427 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 RGRP47804 291 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 ILKQ13418 452 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 FZD2Q14332 565 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 PROX2Q3B8N5 592 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms