RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 RAXQ9Y2V3 346 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 SYCE3A1L190 88 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 RNF8O76064 485 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 GIMD1P0DJR0 217 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ACP1P24666 158 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 MIPP30301 263 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 RABIFP47224 123 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NR1I3Q14994 352 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 HS1BP3Q53T59 392 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CBX8Q9HC52 389 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 DKK4Q9UBT3 224 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PRPSAP2O60256 369 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PRAMEF11O60813 436 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 MMP20O60882 483 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 TIMP2P16035 220 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NDST2P52849 883 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 DAB2P98082 770 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ILKQ13418 452 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 RFX8Q6ZV50 586 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 VPS36Q86VN1 386 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PARGQ86W56 976 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ASB12Q8WXK4 309 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 SCINQ9Y6U3 715 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 RP1P56715 2156 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 DAPK3O43293 454 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 LRCH4O75427 683 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NEBLO76041 1014 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 IGFALSP35858 605 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 LUZP1Q86V48 1076 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 DONSONQ9NYP3 566 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 DKK3Q9UBP4 350 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 KLF15Q9UIH9 416 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 LHX6Q9UPM6 363 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CACNA1GO43497 2377 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CSF2P04141 144 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ALPPL2P10696 532 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 MYF5P13349 255 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ERCC2P18074 760 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PFN3P60673 137 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 FANCCQ00597 558 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 NPWQ8N729 165 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CENPTQ96BT3 561 aa22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 H3BM21 787 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SCAMP1O15126 338 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TM7SF2O76062 418 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 RGRP47804 291 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 FIGNQ5HY92 759 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM11Q96F44 468 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 APOLD1Q96LR9 279 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 ISCUQ9H1K1 167 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.95■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 IGSF10Q6WRI0 2623 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 NEMP2A6NFY4 417 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 K7ESM1 405 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 DFFAO00273 331 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 MYBL1P10243 752 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TCF4P15884 667 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 JUNDP17535 347 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 PBX1P40424 430 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 AFMIDQ63HM1 303 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 HGSNATQ68CP4 663 aa22.94■■□□□ 1.26
PPP4C-212ENST00000567828 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms