RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 BAG5Q9UL15 447 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 GBF1Q92538 1859 aa5.76□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A1W2PPC1 479 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 KCNJ18B7U540 433 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TK1P04183 234 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CSF1P09603 554 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CHN1P15882 459 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 GRAPQ13588 217 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SPATA5Q8NB90 893 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PPM1EQ8WY54 764 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 GOLGA1Q92805 767 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 NYXQ9GZU5 481 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CLPBQ9H078 707 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PANK3Q9H999 370 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 THSD1Q9NS62 852 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 FEM1BQ9UK73 627 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PLXNB2O15031 1838 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.75□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF521Q96K83 1311 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 NCOR1O75376 2440 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 NFATC1O95644 943 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 NR4A2P43354 598 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 FKBP1BP68106 108 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 RHAGQ02094 409 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SEMA3AQ14563 771 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 MTFR2Q6P444 385 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 OPTNQ96CV9 577 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 DEFB118Q96PH6 123 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TRMOQ9BU70 441 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 RMI1Q9H9A7 625 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ARL15Q9NXU5 204 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PHIPQ8WWQ0 1821 aa5.74□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 RHODO00212 210 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SOCS2O14508 198 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ATG13O75143 517 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 NEURL1O76050 574 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 FGF2P09038 288 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TNFRSF1BP20333 461 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 AVPR2P30518 371 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PTGER1P34995 402 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 MCM2P49736 904 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 PRKCZQ05513 592 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 CCL15Q16663 113 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ISM2Q6H9L7 571 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF144BQ7Z419 303 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 HERC6Q8IVU3 1022 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 TDHQ8IZJ6 230 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.73□□□□□ -1.49
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms