RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 OPHN1O60890 802 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SERPINA4P29622 427 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SCNN1BP51168 640 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RENBPP51606 427 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GSDMDP57764 484 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 LLGL1Q15334 1064 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SRLQ86TD4 932 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TTC7BQ86TV6 843 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SKA1Q96BD8 255 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RTKNQ9BST9 563 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CAPN10Q9HC96 672 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ITM2BQ9Y287 266 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.61□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RCCD1A6NED2 376 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PSTPIP1O43586 416 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CER1O95813 267 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 FECHP22830 423 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 IL4RP24394 825 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 MMP13P45452 471 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RGRP47804 291 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GRIA4P48058 902 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ARSEP51690 589 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 VAV2P52735 878 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R38P59533 333 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GBE1Q04446 702 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL2L1Q07817 233 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF5AQ12840 1032 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SGCGQ13326 291 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 STAT4Q14765 748 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GRM3Q14832 879 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC181Q5TID7 509 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC38Q5VT99 294 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 KAZNQ674X7 775 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM69Q86WT6 500 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 HORMAD1Q86X24 394 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM71BQ8TC56 605 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 WNT2BQ93097 391 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 FEM1CQ96JP0 617 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF599Q96NL3 588 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GAREM1Q9H706 876 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 NT5MQ9NPB1 228 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 FZD3Q9NPG1 666 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GGT7Q9UJ14 662 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ALG6Q9Y672 507 aa11.6□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 NRDCO43847 1150 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 MAFKO60675 156 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GJB3O75712 270 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 MX2P20592 715 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CD38P28907 300 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 AKT2P31751 481 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ABL2P42684 1182 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 LIMK1P53667 647 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 MAXP61244 160 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 AP1S1P61966 158 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 GALNT2Q10471 571 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 AP1B1Q10567 949 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TCEAL1Q15170 157 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF19Q2TAC6 998 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 MARC1Q5VT66 337 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ERAP2Q6P179 960 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 IL27RAQ6UWB1 636 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 PQLC3Q8N755 202 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 CXorf40AQ8TE69 158 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB7BQ96AH8 199 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF157Q96PX1 679 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.59□□□□□ -0.55
UBASH3B-208ENST00000533451 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms