RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 MYF6P23409 242 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 WEE1P30291 646 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 OR3A3P47888 321 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PPIL2Q13356 520 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SNX17Q15036 470 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PIGGQ5H8A4 983 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SHEQ5VZ18 495 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 C16orf46Q6P387 395 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MFSD4AQ8N468 514 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 UBR7Q8N806 425 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MCEEQ96PE7 176 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SERPINI1Q99574 410 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MECRQ9BV79 373 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TK2O00142 265 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ACKR2O00590 384 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SNPHO15079 494 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PSTPIP1O43586 416 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 OSBPP22059 807 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 GRIK1P39086 918 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 HCAR3P49019 387 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PRKAA2P54646 552 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 CLCQ05315 142 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SMARCB1Q12824 385 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PEX6Q13608 980 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TTLL4Q14679 1199 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MORF4L2Q15014 288 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 LACC1Q8IV20 430 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF786Q8N393 782 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PARP8Q8N3A8 854 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 LILRB2Q8N423 598 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 IL12RB2Q99665 862 aa8.55□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 BET1O15155 118 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SEC14L2O76054 403 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 KCNH1O95259 989 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PROZP22891 400 aa8.54□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 GRM1Q13255 1194 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ORC1Q13415 861 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 GNA13Q14344 377 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 FSCBQ5H9T9 825 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.54□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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TRPS1-209ENST00000519674 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 CSF3RQ99062 836 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 NUP50Q9UKX7 468 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFA2O43678 99 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TNNC2P02585 160 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 CD19P15391 556 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 SLC9A3P48764 834 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MS4A2Q01362 244 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-209ENST00000519674 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
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