RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	JUP	P14923	745 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ACP1	P24666	158 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PSMA2	P25787	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	IGFALS	P35858	605 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PFN3	P60673	137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	NR1I3	Q14994	352 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ASIC2	Q16515	512 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	NPW	Q8N729	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	EPAS1	Q99814	870 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517		A6NNZ2	444 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517		K7ESM1	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	MUSK	O15146	869 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TSPAN6	O43657	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	CSF2	P04141	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	C1S	P09871	688 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	IL1R2	P27930	398 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	MIP	P30301	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PRKCI	P41743	596 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF165	P49910	485 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	RHOA	P61586	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PARP15	Q460N3	678 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	RFFL	Q8WZ73	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517		A0A1W2PQC6	194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	SCAMP1	O15126	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	LRCH4	O75427	683 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	GCAT	O75600	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	CKMT1A	P12532	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PBX1	P40424	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TPI1	P60174	286 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ASB12	Q8WXK4	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	ATM	Q13315	3056 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RRM2B-204	ENST00000517517	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	NEMP1	O14524	444 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	FPGT	O14772	594 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	IGSF6	O95976	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	GZMA	P12544	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	ERCC2	P18074	760 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	RABIF	P47224	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	AIF1	P55008	147 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	SGCG	Q13326	291 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	ILK	Q13418	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	C1orf61	Q13536	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	PARG	Q86W56	976 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RRM2B-204	ENST00000517517	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms