RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517257.1

RNU6-709P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 709, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-709P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-709P-201ENST00000517257 ADRA1DP25100 572 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 LTBRP36941 435 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CHRNA4P43681 627 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MAPK8P45983 427 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CSNK1DP48730 415 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 EPHB1P54762 984 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ST8SIA6P61647 398 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 AP1S1P61966 158 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CBX1P83916 185 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ECT2LQ008S8 904 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RAD51Q06609 339 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 BCL2L1Q07817 233 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MGAT5Q09328 741 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 NAB1Q13506 487 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 LAMB3Q13751 1172 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 SEPT6Q14141 434 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ADGRE1Q14246 886 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 GALNT3Q14435 633 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 IHHQ14623 411 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RASA2Q15283 850 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 FUT11Q495W5 492 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 LGSNQ5TDP6 509 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MBLAC2Q68D91 279 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CES3Q6UWW8 571 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CYS1Q717R9 158 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MTSS1LQ765P7 747 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TMEM135Q86UB9 458 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RASSF3Q86WH2 238 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 LRRC6Q86X45 466 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CNPY4Q8N129 248 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TTC17Q96AE7 1141 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TLCD1Q96CP7 247 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RMDN1Q96DB5 314 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ASIC4Q96FT7 647 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CERS2Q96G23 380 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RANBP9Q96S59 729 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 PAFAH2Q99487 392 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 KXD1Q9BQD3 176 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 KIFC1Q9BW19 673 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TM6SF2Q9BZW4 377 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CEP44Q9C0F1 390 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 EBF3Q9H4W6 596 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 POMKQ9H5K3 350 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ECT2Q9H8V3 914 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 DEC1Q9P2X7 70 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TBK1Q9UHD2 729 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CD207Q9UJ71 328 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 FBXO10Q9UK96 956 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CHKBQ9Y259 395 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 HS3ST2Q9Y278 367 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 FAM169AQ9Y6X4 670 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CDH23Q9H251 3354 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 COL4A3Q01955 1670 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 A0A1W2PQ67 120 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-709P-201ENST00000517257 CCDC78A2IDD5 438 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms