RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CBY3A6NI87 242 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KLK10O43240 276 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GUCY1B2O75343 617 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MTA2O94776 668 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NDUFB4O95168 129 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CH25HO95992 272 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CD58P19256 250 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPTP24298 496 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ITGB8P26012 769 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CHATP28329 748 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RYKP34925 604 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ERVFC1-1P60608 527 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BNC1Q01954 994 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HYAL1Q12794 435 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COASYQ13057 564 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPFIA1Q13136 1202 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CAPSQ13938 189 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC39A14Q15043 492 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TAF5Q15542 800 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 WDR45BQ5MNZ6 344 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NAA35Q5VZE5 725 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C17orf99Q6UX52 265 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q6ZTC4 211 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CUZD1Q86UP6 607 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CHD1LQ86WJ1 897 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RFWD2Q8NHY2 731 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPT2Q8TD30 523 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GDPD5Q8WTR4 605 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HES6Q96HZ4 224 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGSF21Q96ID5 467 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 YME1L1Q96TA2 773 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARPC5LQ9BPX5 153 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 REEP2Q9BRK0 252 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LMAN2LQ9H0V9 348 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ITM2CQ9NQX7 267 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ICAM5Q9UMF0 924 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NFS1Q9Y697 457 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PER2O15055 1255 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC25A17O43808 307 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CEP104O60308 925 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NBNO60934 754 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TFPIP10646 304 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HSD3B1P14060 373 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PDLIM4P50479 330 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CYP4A11Q02928 519 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SNTA1Q13424 505 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC12A1Q13621 1099 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CALCRLQ16602 461 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FBXO43Q4G163 708 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RFLNBQ8N5W9 214 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF114Q8NC26 417 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DNASE2BQ8WZ79 361 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SNAPC3Q92966 411 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BICD1Q96G01 975 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ADGRG7Q96K78 797 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LMLNQ96KR4 655 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GAREM1Q9H706 876 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SCN5AQ14524 2016 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CPED1A4D0V7 1026 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MAGEA13PA6NCF6 341 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TIMM23O14925 209 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC2A4P14672 509 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SRD5A1P18405 259 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CLCN5P51795 746 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms