RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 COG8Q96MW5 612 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 OLFM1Q99784 485 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL22Q9GZX6 179 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 SETD4Q9NVD3 440 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP10Q9P2G4 905 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 MATN1P21941 496 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXA1P55317 472 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP1A4Q13733 1029 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 EDEM1Q92611 657 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASB7Q9H672 318 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.9□□□□□ -1.3
RAPGEF6-211ENST00000512611 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NME4O00746 187 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAM23O75077 832 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 COQ9O75208 318 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CABYRO75952 493 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 MCF2P10911 925 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC1A2P43004 574 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNA12Q03113 381 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEDD8Q15843 81 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANO4Q32M45 955 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 C4orf22Q6V702 233 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYGBQ8WWM9 190 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 IRGQQ8WZA9 623 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNA7Q96RP8 456 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.9□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HACD1B0YJ81 288 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 KPNA6O60684 536 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIGFQ07326 219 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRPSAP1Q14558 356 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB39AQ14964 217 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 LBX2Q6XYB7 198 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSTM1Q86WC4 334 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 IFNEQ86WN2 208 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLRG1Q96E93 195 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SELENONQ9NZV5 590 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 DSEQ9UL01 958 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACOT9Q9Y305 439 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 HEATR9A2RTY3 570 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7EPI3 171 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBDO15205 165 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGT1A1P22309 533 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGT1A4P22310 534 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ELK4P28324 431 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRPAP1P30533 357 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC7A1P30825 629 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOS2P35228 1153 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGT1A3P35503 534 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGT1A5P35504 534 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP3K7CLP57077 242 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ECT2LQ008S8 904 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC12A1Q13621 1099 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACAP2Q15057 778 aa6.89□□□□□ -1.31
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms