RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PIM3	Q86V86	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	MMP20	O60882	483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TM7SF2	O76062	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CPNE6	O95741	557 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PEX5	P50542	639 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CDK17	Q00537	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CUL4A	Q13619	759 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TAF5	Q15542	800 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ART4	Q93070	314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276		E5RJQ4	531 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	AREL1	O15033	823 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	B4GAT1	O43505	415 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PAGE1	O75459	146 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	YEATS4	O95619	227 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ADCY5	O95622	1261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	GK	P32189	559 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	IRF4	Q15306	451 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	POLQ	O75417	2590 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.4	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	CLDN1	O95832	211 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	DDAH2	O95865	285 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TNF	P01375	233 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	HTR1B	P28222	390 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MTA1	Q13330	715 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	NFATC4	Q14934	902 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MED15	Q96RN5	788 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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