RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.51■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CAPN8A6NHC0 703 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 B3GAT3O94766 335 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RBP1P09455 135 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GSTT1P30711 240 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RAB27AP51159 221 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PKNOX1P55347 436 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 STX5Q13190 355 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SPRYD7Q5W111 196 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 AGMOQ6ZNB7 445 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GCNAQ96QF7 691 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 OMDQ99983 421 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 HACD3Q9P035 362 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CPA4Q9UI42 421 aa15.5■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM38O00635 465 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SDHDO14521 159 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PGGT1BP53609 377 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CEACAM7Q14002 265 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PTK2BQ14289 1009 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CSHL1Q14406 222 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SQLEQ14534 574 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RANBP10Q6VN20 620 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MARK4Q96L34 752 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PATJQ8NI35 1801 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MYLKQ15746 1914 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PFKPQ01813 784 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 AFMIDQ63HM1 303 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 UGT2A3Q6UWM9 527 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SPATA6LQ8N4H0 392 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SGF29Q96ES7 293 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RANBP9Q96S59 729 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PTPN18Q99952 460 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.49■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 E9PAM4 449 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 M0QZQ0 153 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 CTSHP09668 335 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RENBPP51606 427 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SLC5A3P53794 718 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 WNT3AP56704 352 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PELI3Q8N2H9 469 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TOP1MTQ969P6 601 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 UROC1Q96N76 676 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SERPINB11Q96P15 392 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 PKMYT1Q99640 499 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SPON1Q9HCB6 807 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 ADA2Q9NZK5 511 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.48■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 WASH4PA8MWX3 477 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM233B4DJY2 109 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 UBDO15205 165 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GPC4O75487 556 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GRIK1P39086 918 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 RGS2P41220 211 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 BRCC3P46736 316 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 SULT2A1Q06520 285 aa15.47■□□□□ 0.07
C9orf3-218ENST00000482056 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms