RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	IP6K1	Q92551	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PLCH2	O75038	1416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	DDAH2	O95865	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PCNA	P12004	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PTPN2	P17706	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CIITA	P33076	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PTGER1	P34995	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PSMB10	P40306	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	RGS2	P41220	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PTPN9	P43378	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ARSF	P54793	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MC1R	Q01726	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NHLH1	Q02575	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	STIM1	Q13586	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	RPE65	Q16518	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MST1R	Q04912	1400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ABCC1	P33527	1531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	VILL	O15195	856 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMCC1	O94876	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	STARD3NL	O95772	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CD72	P21854	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	GNAQ	P50148	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CLCNKB	P51801	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CREB5	Q02930	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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