RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM232C9JQI7 657 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNDBP1O95273 360 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP3CBP16298 524 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP8P22894 467 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP3A7P24462 503 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CXCR5P32302 372 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCD1P33897 745 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HNF1BP35680 557 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 NNMTP40261 264 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMB10P40306 273 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PBX3P40426 434 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 LRMPQ12912 555 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 DNASE1L3Q13609 305 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX11Q8IYF3 940 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TAGAPQ8N103 731 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 EDAQ92838 391 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 BADQ92934 168 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 R3HDM4Q96D70 268 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SIL1Q9H173 461 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 GLOD4Q9HC38 313 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PDE7BQ9NP56 450 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 DIRC3C9JPN6 131 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM24O15164 1050 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PMPCBO75439 489 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPA4LO95757 839 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ADRB1P08588 477 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CETPP11597 493 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 COX7A2P14406 83 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 LIPAP38571 399 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CLCN2P51788 898 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 VGLL4Q14135 290 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 IRF3Q14653 427 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HS1BP3Q53T59 392 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 HECTD3Q5T447 861 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TTI2Q6NXR4 508 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 VSIG1Q86XK7 387 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SCML4Q8N228 414 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 FRMD1Q8N878 549 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD6Q8NC69 237 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 SCFD2Q8WU76 684 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNJ9Q92806 393 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF31Q96EP0 1072 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR87Q9BY21 358 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 KLQ9UEF7 1012 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PQ09 198 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM170AA1A519 330 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 MARCH11A6NNE9 402 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2CO00762 179 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PER2O15055 1255 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAM20O43506 726 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL18O95568 372 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 FESP07332 822 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 RHOP08100 348 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CREB1P16220 341 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 CD72P21854 359 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPH2P23942 346 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ADRA1DP25100 572 aa5.93□□□□□ -1.46
STRADBP1-201ENST00000478954 ITPKBP27987 946 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms