RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	TIMP2	P16035	220 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PSMA2	P25787	234 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	MIP	P30301	263 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	GK	P32189	559 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DNA2	P51530	1060 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	YPEL5	P62699	121 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	E2F1	Q01094	437 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DPYS	Q14117	519 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	RTP5	Q14D33	572 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CA9	Q16790	459 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	RFX8	Q6ZV50	586 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PARG	Q86W56	976 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	LZTR1	Q8N653	840 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	KLK6	Q92876	244 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM7	Q9C029	511 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	FZD3	Q9NPG1	666 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	NENF	Q9UMX5	172 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307		U3KQA8	63 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	FPGT	O14772	594 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TPP1	O14773	563 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	SIGLEC6	O43699	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF8	O76064	485 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	HNF1B	P35680	557 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PEX5	P50542	639 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CLDN2	P57739	230 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	RHOA	P61586	193 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ELP6	Q0PNE2	266 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	SGCG	Q13326	291 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF599	Q96NL3	588 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CBX8	Q9HC52	389 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	GGT7	Q9UJ14	662 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A087WV48	116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	NEMP2	A6NFY4	417 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307		J3KR12	359 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ALPPL2	P10696	532 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ERCC2	P18074	760 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ZBED6	P86452	979 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	FANCC	Q00597	558 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	IL10RB	Q08334	325 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	UGP2	Q16851	508 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	NPW	Q8N729	165 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF653	Q96CK0	615 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PSKH2	Q96QS6	385 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	ITM2B	Q9Y287	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307		H3BM21	787 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307		K7ESM1	405 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	INSIG1	O15503	277 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	TM7SF2	O76062	418 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	PEX11B	O96011	259 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	SERPING1	P05155	500 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP1A2	P05177	515 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PGAP2-215	ENST00000469307	IL1R2	P27930	398 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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