RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PADI3Q9ULW8 664 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TMCO1Q9UM00 188 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 POMPQ9Y244 141 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DFFAO00273 331 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TNFRSF10BO14763 440 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PFDN6O15212 129 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DCXO43602 365 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 AHCYL1O43865 530 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 USP12O75317 370 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 VAPBO95292 243 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PIGNO95427 931 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 STAMBPO95630 424 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 BAG2O95816 211 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CHRNA1P02708 482 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PIK3R1P27986 724 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GRIK1P39086 918 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PBX3P40426 434 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CPA2P48052 419 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PSMD8P48556 350 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SESN3P58005 492 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RING1Q06587 406 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CDC16Q13042 620 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ART3Q13508 389 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CUL3Q13618 768 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PARP15Q460N3 678 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MARC1Q5VT66 337 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CES3Q6UWW8 571 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NUP93Q8N1F7 819 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TEX26Q8N6G2 289 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ADAM32Q8TC27 787 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NRG4Q8WWG1 115 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 EDEM1Q92611 657 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A13Q96H72 371 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TOX2Q96NM4 488 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FICDQ9BVA6 458 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CEP41Q9BYV8 373 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MIOSQ9NXC5 875 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 IL37Q9NZH6 218 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FAM92AA1XBS5 289 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 OR6C75A6NL08 312 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DRGXA6NNA5 263 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 E9PAM4 449 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 I6L893 689 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 AP1G1O43747 822 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 VPS4BO75351 444 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FESP07332 822 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CLTBP09497 229 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 UQCRBP14927 111 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DPA1P20036 260 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ITGAXP20702 1163 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ME2P23368 584 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ABL2P42684 1182 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MAPKAPK2P49137 400 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ACADVLP49748 655 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC5A3P53794 718 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 NAGLUP54802 743 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A3Q00325 362 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PFKPQ01813 784 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms