RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF599Q96NL3 588 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SEPT3Q9UH03 358 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 IGLON5A6NGN9 336 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 AREL1O15033 823 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SPINT1O43278 529 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CBFA2T3O75081 653 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 THEGLP0DJG4 465 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TIMP2P16035 220 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ARSEP51690 589 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 DPYSL3Q14195 570 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 FGL2Q14314 439 aa24.24■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 PDK2Q15119 407 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP58Q5T655 872 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 OXR1Q8N573 874 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.24■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 YKT6O15498 198 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 GRK6P43250 576 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 RENBPP51606 427 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN2P57739 230 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 RFFLQ8WZ73 363 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 INTUQ9ULD6 942 aa24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 MTA2O94776 668 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ITIH2P19823 946 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINA4P29622 427 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP25P42331 645 aa24.22■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 SUOXP51687 545 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF235Q14590 738 aa24.22■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 INAVAQ3KP66 663 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 PAF1Q8N7H5 531 aa24.22■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 OR13H1Q8NG92 308 aa24.22■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 PSKH2Q96QS6 385 aa24.22■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN11A1L157 253 aa24.21■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.21■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 BRAT1Q6PJG6 821 aa24.21■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.21■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 BBS5Q8N3I7 341 aa24.21■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.21■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 CHD8Q9HCK8 2581 aa24.21■■□□□ 1.47
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SMKR1-201ENST00000462322 A6NNZ2 444 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD11O43934 449 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 PEX11BO96011 259 aa24.2■■□□□ 1.46
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SMKR1-201ENST00000462322 SHC2P98077 582 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 BCL2L1Q07817 233 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 ELP6Q0PNE2 266 aa24.2■■□□□ 1.46
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SMKR1-201ENST00000462322 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 Q6ZSR6 202 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 SAP25Q8TEE9 199 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 ASB12Q8WXK4 309 aa24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 FPGTO14772 594 aa24.19■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.19■■□□□ 1.46
SMKR1-201ENST00000462322 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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