RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 FEM1CQ96JP0 617 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EXOC2Q96KP1 924 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM129BQ96TA1 746 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB17Q9H0T7 212 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FBRSQ9HAH7 460 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0C4DFX4 3053 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SMAPO00193 183 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANXA9O76027 345 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NEBLO76041 1014 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 APBB3O95704 486 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINF2P08697 491 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 COL9A1P20849 921 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CD86P42081 329 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 WASP42768 502 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 COPAP53621 1224 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GRM3Q14832 879 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MORF4L2Q15014 288 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TRADDQ15628 312 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MYLK3Q32MK0 819 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FAXCQ5TGI0 409 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RANBP10Q6VN20 620 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PGBD3Q8N328 593 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF366Q8N895 744 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TMIEQ8NEW7 156 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC45Q96CN5 670 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SNF8Q96H20 258 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MTG2Q9H4K7 406 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DKK3Q9UBP4 350 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 ESYT3A0FGR9 886 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 NDC80O14777 642 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 SPINT1O43278 529 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 PGLSO95336 258 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 ACADMP11310 421 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 MLNP12872 115 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 ITIH2P19823 946 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 ACTN2P35609 894 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS41P49754 854 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 SCNN1BP51168 640 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 GEMP55040 296 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 WNT3AP56704 352 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC7A5Q01650 507 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 SATB1Q01826 763 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 CUL1Q13616 776 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 CRY1Q16526 586 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 TEX35Q5T0J7 233 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 ARMC3Q5W041 872 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR93Q6P2C0 686 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms