RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMIEQ8NEW7 156 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EXD1Q8NHP7 514 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HES6Q96HZ4 224 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC114Q96M63 670 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SGK2Q9HBY8 427 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOD2Q9HC29 1040 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEPT3Q9UH03 358 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PILRBQ9UKJ0 227 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AMFRQ9UKV5 643 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1W2PQU0 124 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSPAN11A1L157 253 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 METTL12A8MUP2 240 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H0Y8X5 98 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAD51BO15315 384 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFIP05156 583 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMP2P08253 660 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIMP2P16035 220 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPN3P26045 913 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OXTRP30559 389 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RWDD2BP57060 319 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AP1B1Q10567 949 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RALGDSQ12967 914 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOMO1Q15155 1222 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BBS12Q6ZW61 710 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VSIG1Q86XK7 387 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TEX26Q8N6G2 289 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCNYQ8ND76 341 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACTL9Q8TC94 416 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF599Q96NL3 588 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PSKH2Q96QS6 385 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEMA3CQ99985 751 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HDAC8Q9BY41 377 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAPN10Q9HC96 672 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DYRK4Q9NR20 520 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCML1Q9UN30 329 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GVT2 93 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC66A2RUB6 948 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A8MX80 341 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MATN3O15232 486 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FANCGO15287 622 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT86O43790 486 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JCHAINP01591 159 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDHA1P08559 390 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCNB1P14635 433 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GM2AP17900 193 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TGM2P21980 687 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LHCGRP22888 699 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPN7P35236 360 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMP12P39900 470 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAPK8P45983 427 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLDN2P57739 230 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IRX4P78413 519 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WASHC5Q12768 1159 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRIK2Q13002 908 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms