RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FBRSQ9HAH7 460 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 APRTP07741 180 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 AOC1P19801 751 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CA4P22748 312 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PSMD8P48556 350 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TRAF2Q12933 501 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SEMA5AQ13591 1074 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP58Q5T655 872 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ERP44Q9BS26 406 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PI15O43692 258 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 MAGEA9P43362 315 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 DGKEP52429 567 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 COPAP53621 1224 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SATB1Q01826 763 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 MTAPQ13126 283 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SLC14A2Q15849 920 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KDELC1Q6UW63 502 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TMIEQ8NEW7 156 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TADA1Q96BN2 335 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 IFT43Q96FT9 208 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 HINFPQ9BQA5 517 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 DPH5Q9H2P9 285 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SARDHQ9UL12 918 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PRR33A8MZF0 331 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SOCS5O75159 536 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 WNT3AP56704 352 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 VOPP1Q96AW1 172 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SNF8Q96H20 258 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 IER2Q9BTL4 223 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CD248Q9HCU0 757 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CHKBQ9Y259 395 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SNX24Q9Y343 169 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PSMD3O43242 534 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 AP2A1O95782 977 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 GUCY2DQ02846 1103 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SPARCL1Q14515 664 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CST6Q15828 149 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 HMGB4Q8WW32 186 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CPT1BQ92523 772 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 FICDQ9BVA6 458 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 MYLKQ15746 1914 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ADH1BP00325 375 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 IVDP26440 423 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CLCN5P51795 746 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 CDK18Q07002 472 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KCNJ11Q14654 390 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 DUPD1Q68J44 220 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 KCTD11Q693B1 232 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXA4-202ENST00000428284 PCGF5Q86SE9 256 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms