RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 ST3GAL1Q11201 340 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 OLIG2Q13516 323 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LAMB3Q13751 1172 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RUNX2Q13950 521 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC142Q17RM4 750 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRT24Q2M2I5 525 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 COLEC12Q5KU26 742 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNX30Q5VWJ9 437 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SHC4Q6S5L8 630 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRILQ7L0X0 811 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PXKQ7Z7A4 578 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CADM3Q8N126 398 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HORMAD2Q8N7B1 307 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RASSF8Q8NHQ8 419 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 POMGNT1Q8WZA1 660 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SGCDQ92629 289 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM18Q96B42 140 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP44Q9H0E7 712 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MVB12BQ9H7P6 319 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ASAH2Q9NR71 780 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SMYD2Q9NRG4 433 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HEY2Q9UBP5 337 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HAO1Q9UJM8 370 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM96BQ9Y3D0 163 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PSAT1Q9Y617 370 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 A0A0U1RQF3 1178 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LIPT2A6NK58 231 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 A6NNC1 897 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 K7ENM7 598 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHL1O00533 1208 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SOCS2O14508 198 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPEF2O14830 753 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LDLRAD4O15165 306 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC25A17O43808 307 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PAGE4O60829 102 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MOSPD3O75425 235 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NDUFB8O95169 186 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRF1P14222 555 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ARSBP15848 533 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHRNB2P17787 502 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ALOX12P18054 663 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SRD5A1P18405 259 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CD58P19256 250 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GNLYP22749 145 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPTP24298 496 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DCTDP32321 178 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GNAQP50148 359 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAD23BP54727 409 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLDN2P57739 230 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZP1P60852 638 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRAMEP78395 509 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LPIN1Q14693 890 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPP2R5BQ15173 497 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DUSP6Q16828 381 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TCTN1Q2MV58 587 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EPHA10Q5JZY3 1008 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KIAA2013Q8IYS2 634 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GJC3Q8NFK1 279 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CEP76Q8TAP6 659 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CREB3L4Q8TEY5 395 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP6NLQ92738 828 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GTF3C6Q969F1 213 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FBXL8Q96CD0 374 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NLRP4Q96MN2 994 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 BBS4Q96RK4 519 aa2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIN3AQ96ST3 1273 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms