RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CRHR1P34998 444 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLK1P53350 603 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TREML2Q5T2D2 321 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ULK1O75385 1050 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CD52P31358 61 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GSTA3Q16772 222 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TEX44Q53QW1 395 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF276Q8N554 614 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.211e-11■■■■■ 35.3
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KLQ9UEF7 1012 aa16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PSME3P61289 254 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR4L1Q8NH43 312 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LGMNQ99538 433 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AKAP12Q02952 1782 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C19orf60Q96EN9 201 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ITGA2P17301 1181 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CENPAP49450 140 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMIM11AP58511 58 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRKG2Q13237 762 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTPRNQ16849 979 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ELMO1Q92556 727 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP7Q93009 1102 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TLR5O60602 858 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CALCAP01258 141 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WNT3AP56704 352 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CYP20A1Q6UW02 462 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VWA7Q9Y334 891 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.38■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HS6ST1O60243 411 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TBL1XO60907 577 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 JAK1P23458 1154 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF614Q8N883 585 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PALMDQ9NP74 551 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BPGMP07738 259 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBE3AQ05086 875 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TDRPQ86YL5 185 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC103Q8IW40 242 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDH19Q9H159 772 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AZIN1O14977 448 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PGK1P00558 417 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDKN2BP42772 138 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCR3P51677 355 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TTC27Q6P3X3 843 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DENND1CQ8IV53 801 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SH3GL2Q99962 352 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FETUBQ9UGM5 382 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MED26O95402 600 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DLGAP3O95886 979 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RHOQP17081 205 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCNCP24863 283 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EVX2Q03828 476 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FIBCD1Q8N539 461 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C12orf29Q8N999 325 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CPXM1Q96SM3 734 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC9A7Q96T83 725 aa16.37■□□□□ 0.21
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TTPALQ9BTX7 342 aa16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms