RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341919.7

NFIC-201, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIC, Length 1,573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-201ENST00000341919 PDK2Q15119 407 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TMTC1Q8IUR5 882 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PAF1Q8N7H5 531 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 LRIG1Q96JA1 1093 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 INTUQ9ULD6 942 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ALG6Q9Y672 507 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 A0A0U1RQJ8 604 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TLR4O00206 839 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 VILLO15195 856 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SPOPO43791 374 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 KRT1P04264 644 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 DYNLT1P63172 113 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ITKQ08881 620 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ZNF235Q14590 738 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NPNTQ6UXI9 565 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 GATAD2AQ86YP4 633 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 HEY1Q9Y5J3 304 aa16■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 CER1O95813 267 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SERPINB6P35237 376 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PTPRRQ15256 657 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NEK5Q6P3R8 708 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 CCNYQ8ND76 341 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RNF157Q96PX1 679 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ZNF670Q9BS34 389 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NT5MQ9NPB1 228 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SEPT3Q9UH03 358 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 POM121BA6NF01 834 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 BCL2L1Q07817 233 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 BNIP3Q12983 259 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SGCGQ13326 291 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ODF2Q5BJF6 829 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 CFAP58Q5T655 872 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MARC1Q5VT66 337 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 PIP4P1Q86T03 277 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RFX6Q8HWS3 928 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 DESI2Q9BSY9 194 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NOD2Q9HC29 1040 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.98■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 AREL1O15033 823 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 THEGLP0DJG4 465 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 KRT10P13645 584 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MMP13P45452 471 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MARCKSL1P49006 195 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 TCEAL1Q15170 157 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 UGP2Q16851 508 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 KAZNQ674X7 775 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NAXDQ8IW45 347 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 OR13H1Q8NG92 308 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.97■□□□□ 0.15
NFIC-201ENST00000341919 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms