RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 SGSM3Q96HU1 749 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MYLKQ15746 1914 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MROH6A6NGR9 719 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SPAG7O75391 227 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NDST3O95803 873 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ARNTP27540 789 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 HLA-FP30511 346 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CD70P32970 193 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 EXOC2Q96KP1 924 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MARK1Q9P0L2 795 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 RFPL1O75677 317 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MT-CO1P00395 513 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ALADP13716 330 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GRTP1Q5TC63 336 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 EPN3Q9H201 632 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SIN3BO75182 1162 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GLP2RO95838 553 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PRLP01236 227 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PAMP19021 973 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 BMP8BP34820 402 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CCNFP41002 786 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 WDR4P57081 412 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 BMPR2Q13873 1038 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CNGA3Q16281 694 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MROH9Q5TGP6 573 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PEX13Q92968 403 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 AGAP2Q99490 1192 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 BBS2Q9BXC9 721 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MKS1Q9NXB0 559 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC78A2IDD5 438 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GOLGA8RI6L899 631 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 RFXAPO00287 272 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LDB2O43679 373 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ZWINTO95229 277 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ASMTLO95671 621 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 PYGBP11216 843 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CA4P22748 312 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 RHOAP61586 193 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LAMB3Q13751 1172 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SEPT6Q14141 434 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC14Q15048 493 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GPR149Q86SP6 731 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 RNF135Q8IUD6 432 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 MGARPQ8TDB4 240 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 APOPT1Q96IL0 206 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 RBBP8Q99708 897 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GMNCA6NCL1 334 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 K7ERQ8 282 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 TM9SF1O15321 606 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 VAPBO95292 243 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ITGA2BP08514 1039 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 TYRP14679 529 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 CSNK1DP48730 415 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 NEK3P51956 506 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 LIMK2P53671 638 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 SEC24CP53992 1094 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 AP1S1P61966 158 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 ACVR1Q04771 509 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-202ENST00000338045 GALNT3Q14435 633 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms