RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 VAT1Q99536 393 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 FANCGO15287 622 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 CES1P23141 567 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CASQ1P31415 396 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 NEK3P51956 506 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 AGBL4Q5VU57 503 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 GPR174Q9BXC1 333 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 HDAC8Q9BY41 377 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SGK2Q9HBY8 427 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 CD86P42081 329 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf74Q86VG3 221 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB119Q8N690 84 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 USP29Q9HBJ7 922 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 GLOD4Q9HC38 313 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA4FO95754 770 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ADRB3P13945 408 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PRLRP16471 622 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ADPRHP54922 357 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CCNG2Q16589 344 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 DKK3Q9UBP4 350 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PRR23AA6NEV1 266 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 F5H423 210 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A4O43246 635 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SOCS5O75159 536 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 NFKB1P19838 968 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TRAF2Q12933 501 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 LPAL2Q16609 132 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TTC7BQ86TV6 843 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 FRYLO94915 3013 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP69A5D8W1 941 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 MMP2P08253 660 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 GDF10P55107 478 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 IHHQ14623 411 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ELF2Q15723 593 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PLK5Q496M5 336 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PRELID2Q8N945 189 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.54■■□□□ 1.2
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HOXD4-201ENST00000306324 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.53■■□□□ 1.2
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