RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPTQ96BT3 561 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZPBPQ9BS86 351 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SPON2Q9BUD6 331 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CLPBQ9H078 707 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SIK2Q9H0K1 926 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 WDCPQ9H6R7 721 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR6Q9Y217 621 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ILVBLA1L0T0 632 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAP91O60641 907 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD1O60671 282 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ENDOD1O94919 500 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-CO1P00395 513 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 F9P00740 461 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-25P01717 112 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LIFP15018 202 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TCN2P20062 427 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT1A3P35503 534 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LRMPQ12912 555 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NME3Q13232 169 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NFATC4Q14934 902 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC14Q15048 493 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP58Q5T655 872 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRED1Q7Z699 444 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR156Q8NFN8 814 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TFAP2BQ92481 460 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM81BQ96LP2 452 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR92Q96MX6 357 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL8A6PVC2 850 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 K7ERQ8 282 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KRIT1O00522 736 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 MTSS1O43312 755 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 PAGE1O75459 146 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT7P08729 469 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFALSP35858 605 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ETV5P41161 510 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GPD2P43304 727 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GCNT1Q02742 428 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC20Q12834 499 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 AMZ1Q400G9 498 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf22Q49AR2 442 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CBWD6Q4V339 395 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 EFHC2Q5JST6 749 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 ERAP2Q6P179 960 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 LINGO4Q6UY18 593 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM110Q86TL2 294 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB106AQ8N104 65 aa7.96□□□□□ -1.14
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