RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM131Q92545 1883 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATMQ13315 3056 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL8A6PVC2 850 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SYN3O14994 580 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3BP5O60239 455 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OPHN1O60890 802 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG7O75391 227 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1G2O95670 118 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CD59P13987 128 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNB1P14635 433 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF4P15884 667 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TPSB2P20231 275 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ITPKAP23677 461 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTFP26441 200 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1R2P27930 398 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FDFT1P37268 417 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEA6P43360 314 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN9P43378 593 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BCAT1P54687 386 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH8P55286 799 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NCALDP61601 193 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK16Q00536 496 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PTSQ03393 145 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NAB1Q13506 487 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TPSAB1Q15661 275 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DBN1Q16643 649 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP6Q2NL67 630 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf27AQ580R0 203 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG16L1Q676U5 607 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DPH6Q7L8W6 267 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CHSY1Q86X52 802 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT12Q8IV01 421 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNJLQ8IV13 435 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF843Q8N446 348 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ACDQ96AP0 544 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HSFY1Q96LI6 401 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PWWP2AQ96N64 755 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SDCBP2Q9H190 292 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX25Q9H3E2 840 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 YY1AP1Q9H869 796 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NOD2Q9HC29 1040 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OBP2AQ9NY56 170 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTA1P02549 2419 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 E5RJQ4 531 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 E7ENQ6 273 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 J3QKU1 62 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 COPEO14579 308 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF10BO14763 440 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNN4O15554 427 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TYROBPO43914 113 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC5CO95185 931 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TGDSO95455 350 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1BP01584 269 aa7.16□□□□□ -1.26
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