RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 SEMG2Q02383 582 aa8.75□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 AGKQ53H12 422 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 IL23RQ5VWK5 629 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 LIPMQ5VYY2 423 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ARMC3Q5W041 872 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CST9Q5W186 159 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 IFNEQ86WN2 208 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.75□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 HDAC11Q96DB2 347 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GPR78Q96P69 363 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 FAM50BQ9Y247 325 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 SUPT7LO94864 414 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 IL1BP01584 269 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GSTA2P09210 222 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CASP2P42575 452 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 SLC12A2P55011 1212 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 AAK1Q2M2I8 961 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CCDC153Q494R4 210 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GIPC2Q8TF65 315 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.015e-7■■■□□ 15.7
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GINS1-201ENST00000262460 TBATAQ96M53 351 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GPR22Q99680 433 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 IL22Q9GZX6 179 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 VCXQ9H320 206 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 USP22Q9UPT9 525 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 E9PAM4 449 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 M0QZ92 97 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 MUSKO15146 869 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 DDHD2O94830 711 aa8.75□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 MTTPP55157 894 aa8.75□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 PDK3Q15120 406 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 XKR4Q5GH76 650 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 NEPROQ6NW34 567 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 KDM1BQ8NB78 822 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 KYQ8NBH2 561 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 RHOJQ9H4E5 214 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GPAMQ9HCL2 828 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 GMIPQ9P107 970 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CDYLQ9Y232 598 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 A0A0D9SEW6 157 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 F8W8V4 182 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 FBXO21O94952 628 aa8.74□□□□□ -1.01
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GINS1-201ENST00000262460 CPB1P15086 417 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CKMT2P17540 419 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 LRPAP1P30533 357 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 GSTT1P30711 240 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 MED21Q13503 144 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 PRPSAP1Q14558 356 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 SEMA3AQ14563 771 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 RAB41Q5JT25 222 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 DRC3Q9H069 523 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS1-201ENST00000262460 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.74□□□□□ -1.01
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