RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 RDH14Q9HBH5 336 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 VPS51Q9UID3 782 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ITM2BQ9Y287 266 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 TOR1BO14657 336 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 VDRP11473 427 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 NR2F2P24468 414 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 SYKP43405 635 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 KRT85P78386 507 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ENPEPQ07075 957 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ALG11Q2TAA5 492 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 KRT39Q6A163 491 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 BEND5Q7L4P6 421 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 VPS36Q86VN1 386 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 HID1Q8IV36 788 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 TFAP2BQ92481 460 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 DDA1Q9BW61 102 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 DONSONQ9NYP3 566 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 FBN3Q75N90 2809 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 SVILO95425 2214 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CPNE6O95741 557 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CTSEP14091 401 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 KRT83P78385 493 aa16.65■□□□□ 0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 UBR7Q8N806 425 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ART4Q93070 314 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 HSFY1Q96LI6 401 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 MIS12Q9H081 205 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 MUC3BQ9H195 1237 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CASS4Q9NQ75 786 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.65■□□□□ 0.26
SPCS1-201ENST00000233025 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL8A6PVC2 850 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RASGRP1O95267 797 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 LDLRP01130 860 aa16.64■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 PIM3Q86V86 326 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 STARD8Q92502 1023 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 HAPLN3Q96S86 360 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RAB20Q9NX57 234 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 POLEQ07864 2286 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 M0QYV0 167 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN11O75508 207 aa16.63■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 MXI1P50539 228 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CUL2Q13617 745 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.63■□□□□ 0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 KRBA2Q6ZNG9 492 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RAB7BQ96AH8 199 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TCTN2Q96GX1 697 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SPRY4Q9C004 299 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD3Q9Y597 815 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 DNHD1Q96M86 4753 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 B4GAT1O43505 415 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ENDOD1O94919 500 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PDGFAP04085 211 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KRT13P13646 458 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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