RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 C9orf172C9J069 976 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 K7ERQ8 282 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ZW10O43264 779 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 PNLIPP16233 465 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 GLB1P16278 677 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 GGCXP38435 758 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 GPD2P43304 727 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 DNA2P51530 1060 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 IRAK1P51617 712 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 HK3P52790 923 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 GCNT1Q02742 428 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 IGFBP7Q16270 282 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 C5orf22Q49AR2 442 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 LRRC31Q6UY01 552 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 LINGO4Q6UY18 593 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SPRED1Q7Z699 444 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA20Q8TB22 786 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SLC35C1Q96A29 364 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 HAPLN3Q96S86 360 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 EPAS1Q99814 870 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CLPBQ9H078 707 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 APPL1Q9UKG1 709 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.77□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 PAGE1O75459 146 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 DAB1O75553 588 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 TM7SF2O76062 418 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CNTN5O94779 1100 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ENDOD1O94919 500 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 OR1E1P30953 314 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ETFBP38117 255 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ETV5P41161 510 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ABL2P42684 1182 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SYKP43405 635 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 FMO5P49326 533 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 PEX5P50542 639 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SLC20A2Q08357 652 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 DPYDQ12882 1025 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 NME3Q13232 169 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 PDCLQ13371 301 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SEPT6Q14141 434 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGEF7Q14155 803 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CARD16Q5EG05 197 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM110Q86TL2 294 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 HID1Q8IV36 788 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CENPTQ96BT3 561 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 SIK2Q9H0K1 926 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM51Q9NW97 253 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 KLQ9UEF7 1012 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 GGT7Q9UJ14 662 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ITM2BQ9Y287 266 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.76□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1B0GVL5 298 aa8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 ILVBLA1L0T0 632 aa8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 AGFG2O95081 481 aa8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CPNE6O95741 557 aa8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 KRT5P13647 590 aa8.75□□□□□ -1.01
HLA-B-257ENST00000640094 LIFP15018 202 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms