RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 RALAP11233 206 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 VAV1P15498 845 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 JUNDP17535 347 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 GARTP22102 1010 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 NOS2P35228 1153 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCT5P48643 541 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TNNC1P63316 161 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 HORMAD1Q86X24 394 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 XYLT1Q86Y38 959 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RBFAQ8N0V3 343 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ARL10Q8N8L6 244 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 KLK6Q92876 244 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 C5orf34Q96MH7 638 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SPAG5Q96R06 1193 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 WDR24Q96S15 920 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PLIN2Q99541 437 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 POLEQ07864 2286 aa11.94□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 STAB1Q9NY15 2570 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 POM121BA6NF01 834 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 AGRPO00253 132 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 KIF5CO60282 957 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCDC175P0C221 793 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCL4P13236 92 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 APBA1Q02410 837 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SNCBQ16143 134 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 NEK5Q6P3R8 708 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 WDR49Q8IV35 697 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 COG1Q8WTW3 980 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 TNIP3Q96KP6 325 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PANX2Q96RD6 677 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CGRRF1Q99675 332 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CLPBQ9H078 707 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.93□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 RAD1O60671 282 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FAM200BP0CF97 657 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SETSIPP0DME0 302 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 MYBL2P10244 700 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PAX7P23759 505 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 UBASH3AP57075 661 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 STIM1Q13586 685 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SETDB1Q15047 1291 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCDC38Q502W7 563 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PITRM1Q5JRX3 1037 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 EFHC2Q5JST6 749 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ADGRF1Q5T601 910 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ACOT1Q86TX2 421 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 MFN1Q8IWA4 741 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FIBINQ8TAL6 211 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 FRS2Q8WU20 508 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SDCBP2Q9H190 292 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 SPASTQ9UBP0 616 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.92□□□□□ -0.5
HCG18-241ENST00000602290 KCTD3Q9Y597 815 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms