RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 SEPT6Q14141 434 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 ATG16L1Q676U5 607 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 GAREM2Q75VX8 874 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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USP36-218ENST00000590546 WBP2Q969T9 261 aa22.65■■□□□ 1.22
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USP36-218ENST00000590546 MUC3BQ9H195 1237 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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USP36-218ENST00000590546 GREM1O60565 184 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 VAPBO95292 243 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 CKMP06732 381 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 CTNNB1P35222 781 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 SGSHP51688 502 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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USP36-218ENST00000590546 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.64■■□□□ 1.22
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USP36-218ENST00000590546 SLC22A12Q96S37 553 aa22.64■■□□□ 1.22
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USP36-218ENST00000590546 SNX15Q9NRS6 342 aa22.64■■□□□ 1.22
USP36-218ENST00000590546 H0Y626 953 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 RNF43Q68DV7 783 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 LCA5Q86VQ0 697 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 CPXM2Q8N436 756 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 CCDC63Q8NA47 563 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 ZNF398Q8TD17 642 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 CCT6BQ92526 530 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 VPS39Q96JC1 886 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 OBSL1O75147 1896 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 CGB2Q6NT52 195 aa22.63■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 MUSKO15146 869 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 TGDSO95455 350 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 DNAJB1P25685 340 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 CYP4F8P98187 520 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 CCDC153Q494R4 210 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 TLR9Q9NR96 1032 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.62■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 MROH6A6NGR9 719 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 INSIG1O15503 277 aa22.61■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 SLC7A4O43246 635 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 CR2P20023 1033 aa22.61■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 ALDH3A1P30838 453 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 E2F7Q96AV8 911 aa22.61■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP36-218ENST00000590546 CCDC78A2IDD5 438 aa22.61■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 SOBPA7XYQ1 873 aa22.61■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 ARNTP27540 789 aa22.61■■□□□ 1.21
USP36-218ENST00000590546 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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