RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.57■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.57■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM114B3SHH9 223 aa20.56■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TEKT5Q96M29 485 aa20.56■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.56■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 LAMA3Q16787 3333 aa20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA13P48723 471 aa20.55■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CDH17Q12864 832 aa20.54■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 HPS6Q86YV9 775 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.54■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-205ENST00000564630 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-205ENST00000564630 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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