RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	22.1	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KNTC1	P50748	2209 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF14	O43557	240 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PCK1	P35558	622 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAP1	Q15027	740 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CYTH1	Q15438	398 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	INAVA	Q3KP66	663 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RFX8	Q6ZV50	586 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB7B	Q96AH8	199 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FEM1C	Q96JP0	617 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOC	Q99972	504 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD3	Q9NPG1	666 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	22.09	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087X0T9	212 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF11	O60813	436 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT2B4	P06133	528 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM228B	P0C875	321 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1R2	P27930	398 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	AKT2	P31751	481 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	HCAR3	P49019	387 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	BNIP3	Q12983	259 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX3	Q9UBR4	397 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NENF	Q9UMX5	172 aa		22.08	■■□□□ 1.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200		J3KR12	359 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	AREL1	O15033	823 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN6	O43657	245 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGAV	P06756	1048 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	THEGL	P0DJG4	465 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF4	P15884	667 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC2	P18074	760 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOA	P61586	193 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS36	Q86VN1	386 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13H1	Q8NG92	308 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	BMF	Q96LC9	184 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP2	Q9H0W7	228 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR27	Q9NS67	375 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	GGT7	Q9UJ14	662 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	22.07	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD51B	O15315	384 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	INSIG1	O15503	277 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF6	O95976	241 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP14	P31944	242 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN2	P57739	230 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DPYS	Q14117	519 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DPYSL2	Q16555	572 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	NPW	Q8N729	165 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DKK3	Q9UBP4	350 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ITM2B	Q9Y287	266 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP1A2	P05177	515 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB12	Q8WXK4	309 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		22.06	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	POM121B	A6NF01	834 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLON5	A6NGN9	336 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD51	Q06609	339 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	BOLA3	Q53S33	107 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC2	Q96KP1	924 aa		22.05	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DAPK3	O43293	454 aa		22.04	■■□□□ 1.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMP2	P16035	220 aa		22.04	■■□□□ 1.12

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms