RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	KRT38	O76015	456 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CD160	O95971	181 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	FGF1	P05230	155 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	BRAF	P15056	766 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CNTF	P26441	200 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SCNN1B	P51168	640 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	LINGO4	Q6UY18	593 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	APCDD1	Q8J025	514 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	EFHB	Q8N7U6	833 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	RANBP9	Q96S59	729 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SMC6	Q96SB8	1091 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	TRABD	Q9H4I3	376 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	NOD2	Q9HC29	1040 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	MARK1	Q9P0L2	795 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	ZFAT	Q9P243	1243 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	RFXAP	O00287	272 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	PAM	P19021	973 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CHRNA4	P43681	627 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	RHOA	P61586	193 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	LAMB3	Q13751	1172 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	IHH	Q14623	411 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CES3	Q6UWW8	571 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	RASSF3	Q86WH2	238 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	MTBP	Q96DY7	904 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	MFSD3	Q96ES6	412 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	GDE1	Q9NZC3	331 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	NDST3	O95803	873 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CA4	P22748	312 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	CD70	P32970	193 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	RGR	P47804	291 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SMARCD2	Q92925	531 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	LMLN	Q96KR4	655 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	LHX3	Q9UBR4	397 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	TRANK1	O15050	2925 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM120B	A0PK00	339 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	GLP2R	O95838	553 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	MT-ND3	P03897	115 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	ALAD	P13716	330 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	TYR	P14679	529 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	NMBR	P28336	390 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	HYAL1	Q12794	435 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	DMC1	Q14565	340 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	MZB1	Q8WU39	189 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	FGF13	Q92913	245 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	EXOC2	Q96KP1	924 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	GJB3	O75712	270 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	ERVK-10	P10266	1014 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	HLA-F	P30511	346 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	MAPK8	P45983	427 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	SLC18A1	P54219	525 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	AP1S1	P61966	158 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	GNGT1	P63211	74 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	GUCY1A3	Q02108	690 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	SULT2A1	Q06520	285 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	SEPT6	Q14141	434 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	KCNMB4	Q86W47	210 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	CENPT	Q96BT3	561 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	ASB16	Q96NS5	453 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	TRIB3	Q96RU7	358 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-227	ENST00000556736	CPNE1	Q99829	537 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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