RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 IQCDQ96DY2 449 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MCEEQ96PE7 176 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 HDAC8Q9BY41 377 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CBX8Q9HC52 389 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PREBQ9HCU5 417 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FZD10Q9ULW2 581 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 BSNQ9UPA5 3926 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SERPINC1P01008 464 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CKMT1AP12532 417 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DGKAP23743 735 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LSSP48449 732 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TAS2R38P59533 333 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TPM4P67936 248 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ASIC2Q16515 512 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 BROXQ5VW32 411 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LINGO4Q6UY18 593 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DRC7Q8IY82 874 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TTC9Q92623 222 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 VOPP1Q96AW1 172 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SPON2Q9BUD6 331 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DPH1Q9BZG8 443 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ISCUQ9H1K1 167 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DONSONQ9NYP3 566 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 B8ZZF3 427 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.531e-14■■□□□ 14.3
CS-221ENST00000550734 KDELR3O43731 214 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 OPA1O60313 960 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RAMP2O60895 175 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SDC3O75056 442 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MPOP05164 745 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 GP1BAP07359 652 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MYBL1P10243 752 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DESP17661 470 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ACVRL1P37023 503 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FANCCQ00597 558 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 OGDHQ02218 1023 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CARD16Q5EG05 197 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 EFHC2Q5JST6 749 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 HGSNATQ68CP4 663 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TMC6Q7Z403 805 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LUZP1Q86V48 1076 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 EPAS1Q99814 870 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CPNE5Q9HCH3 593 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 IL36AQ9UHA7 158 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 AP1G1O43747 822 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 LEFTY1O75610 366 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 GSRP00390 522 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-221ENST00000550734 C6P13671 934 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms