RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550155.5

CNOT2-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2

Gene CNOT2, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ANP32C	O43423	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	GRID2	O43424	1007 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC25A17	O43808	307 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM155B	O75949	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TK1	P04183	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TFPI	P10646	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CTPS1	P17812	591 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	LIFR	P42702	1097 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CENPA	P49450	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ARSF	P54793	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ACTR2	P61160	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MYBPH	Q13203	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	SNTA1	Q13424	505 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CAPS	Q13938	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TRIB2	Q92519	343 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	HSPH1	Q92598	858 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	STX16	O14662	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CLGN	O14967	610 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	VNN2	O95498	520 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	FMO4	P31512	558 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	HNF1B	P35680	557 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CHKA	P35790	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	EPYC	Q99645	322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	RXRA	P19793	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	HDAC4	P56524	1084 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CALCRL	Q16602	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	TIMM23	O14925	209 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	MTA2	O94776	668 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ADA	P00813	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	DDR1	Q08345	913 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-222	ENST00000550155	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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